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PCR儀的測序反應(yīng)試驗(yàn)講解
點(diǎn)擊次數(shù):1464 更新時間:2021-07-23
PCR儀進(jìn)行測序反應(yīng)試驗(yàn)時應(yīng)按照步驟依次進(jìn)行:
1.取0.2ml的PCR管,用記號筆編號,將管插在顆粒冰中,加入規(guī)定試劑。總反應(yīng)體積5μl,不加輕礦物油或石蠟油,蓋緊PCR管,用手指彈管混勻,稍離心。將PCR管置于PCR儀上進(jìn)行擴(kuò)增。98℃變性2min后進(jìn)行PCR循環(huán),PCR循環(huán)參數(shù)為96℃10秒,50℃5秒,60℃4分鐘,25個循環(huán),擴(kuò)增結(jié)束后設(shè)置4℃保溫。
醋酸鈉/乙醇法純化PCR產(chǎn)物:
1.將混合物離心,將擴(kuò)增產(chǎn)物轉(zhuǎn)移到1.5ml EP管中;
2.加入25μl醋酸鈉/乙醇混合液,充分振蕩,置冰上10min以沉淀DNA。12000r/min于4℃離心30min,小心棄上清;
3.加70%(V/V)的乙醇50μl洗滌沉淀2次。12000r/min于4℃離心5min,小心棄上清和管壁的液珠,真空干燥沉淀10-15min。
電泳前測序PCR產(chǎn)物的處理:
1.加入12μl的TSR于離心管中,劇烈振蕩,讓其充分溶解DNA沉淀,稍離心;
2.將溶液轉(zhuǎn)移至蓋體分離的0.2ml PCR管中,稍離心;
3.在PCR儀上進(jìn)行熱變性(95℃2min),冰中驟冷,待上機(jī)。
具體上機(jī)操作按PCR儀說明書安裝毛細(xì)管,進(jìn)行毛細(xì)管位置的校正,人工手動灌膠和建立運(yùn)行的測序順序文件。儀器將自動灌膠至毛細(xì)管,1.2kV預(yù)電泳5min,按編程次序自動進(jìn)樣,再預(yù)電泳(1.2kV,20min),在7.5kV下電泳2h。電泳結(jié)束后儀器會自動清洗,灌膠,進(jìn)下一樣品,預(yù)電泳和電泳。每一個樣品電泳總時間為2.5h。電泳結(jié)束后儀器會自動分析或打印出彩色測序圖譜。
儀器將自動進(jìn)行序列分析,并可根據(jù)用戶要求進(jìn)行序列比較。如測序序列已知,可通過序列比較以星號標(biāo)出差異堿基處,提高工作效率。
測序完畢按PCR儀操作規(guī)程進(jìn)行儀器清洗與保養(yǎng)。